Vorhersage von Antikörper-Subrepertoires, Hochschule für Life Sciences FHNW

Die Entdeckung neuartiger Antikörper gegen Infektionskrankheiten und Krebs wird beschleunigt. Der Teil des Antikörperrepertoires, der spezifisch gegen einen bestimmten Erreger gerichtet ist, wird als dessen spezifisches Antikörper-Subrepertoire bezeichnet und macht nur einen Bruchteil der von einem Individuum produzierten Antikörper aus. Das Wissen über pathogen-spezifische Antikörper-Subrepertoires würde die Arzneimittelentwicklung in der Präzisionsmedizin enorm beschleunigen, beispielsweise bei der Entdeckung neuartiger Antikörper gegen Krebs-Neoepitope. Die Regeln für die Entwicklung pathogen-spezifischer Antikörper und deren Zusammenhang mit unspezifischen Antikörpern im Repertoire sind jedoch noch nicht geklärt.

Danio rerio (Zebrafisch) ist eines der frühesten bekannten Tiere, das ein adaptives Immunsystem entwickelt hat, das dem des Menschen ähnelt. Es enthält Ig-Genloci, die sowohl organisatorisch ähnlich sind als auch Gene enthalten, die der menschlichen Antikörperentwicklung ähneln. Dazu gehören die der kombinatorische Neuanordnung von Antikörpergensegmenten (variabel, divers, junktional) sowie somatische Hypermutation.

Mithilfe aktueller Antikörper-Sequenzierungstechniken kann das gesamte Antikörper-Repertoire des Zebrafisches mittels Hochdurchsatz-Sequenzierung erfasst werden. Wir möchten das pathogen-spezifische Antikörper-Subrepertoire im Zebrafisch-Tiermodell untersuchen, um die Grundlagen für die Identifizierung und Vorhersage von Subrepertoires in einem verallgemeinerten Rahmen zu schaffen.