Entwickeln Sie praktische Fähigkeiten in der Analyse von next- und 3rd Generation-Sequenzierungsdaten durch eine Kombination aus Vorträgen von Expert*innen, interaktiven Übungen und Fallstudien aus der Praxis. Erwerben Sie fundierte theoretische Grundlagen und praktische Fachkenntnisse in der angewandten Bioinformatik.
Steckbrief
- Abschluss
- Certificate of Advanced Studies FHNW Applied Bioinformatics: Next- and 3rd Generation Sequencing Data Analysis
- Lernsetting
- Remote und Präsenz
- ECTS-Punkte
- 12
- Nächster Start
- 1.4.2027
- Dauer
- 12 Tage
- Durchführungssprache
- Englisch
- Durchführungsort
- Online und FHNW Campus Muttenz
- Preis
- CHF 6 800
Auf einen Blick
- Entwickeln Sie Kernkompetenzen in den Bereichen Next-Generation-Sequenzierung und Nanopore-Technologie unter Verwendung von Unix, Python und Git für effektive und reproduzierbare Workflows in der Bioinformatik.
- Erlangen Sie Sicherheit im Umgang mit weit verbreiteten Open-Source-Bioinformatik-Tools und -Datenbanken, darunter GATK, Ensembl, ClinVar und Kraken.
- Wenden Sie Ihr Wissen in praktischen Übungen mit realen Fallstudien aus Forschung und klinischem Kontext an.
- Flexible Teilnahmeoptionen: vollständig online oder mit der Möglichkeit, die erste und letzte Vorlesung vor Ort zu besuchen.
Ziele und Nutzen
Nach Abschluss des CAS-Programms können Sie:
- grundlegende Programmier- und Rechenkenntnisse im Rahmen der Bioinformatik anwenden
- die Vorverarbeitung und Primäranalyse von Rohsequenzierungsdaten, die mit Next-Generation- und Nanopore-Sequenzierungstechnologien gewonnen wurden, durchführen
- Sequenzierungsergebnisse unter Berücksichtigung ihrer biologischen und klinischen Relevanz interpretieren und visualisieren.
- öffentlich zugängliche Datenbanken und Annotationsressourcen integrieren, um eine fundierte genomische Interpretation zu unterstützen.
- reproduzierbare und gut dokumentierte Analyse-Pipelines mithilfe von Skript-Tools entwickeln.
Im Rahmen des Programms bearbeiten Sie ein individuelles Projekt unter Verwendung Ihres eigenen Datensatzes oder eines von Ihrer Institution bereitgestellten Datensatzes, das den gesamten bioinformatischen Workflow von der Verarbeitung der Rohdaten bis zur abschliessenden Interpretation umfasst.
Zielpublikum
Dieses CAS ist genau das Richtige für Sie, wenn Sie in den Bereichen Biowissenschaften, Gesundheitswesen oder Forschung tätig sind und praktische Kompetenzen in der Bioinformatik aufbauen möchten. Er ist besonders relevant, wenn Sie:
- mit Next-Generation- und Nanopore-Sequenzierungsdaten arbeiten oder dies planen.
- in den Biowissenschaften oder der Forschung tätig sind und genomische oder transkriptomische Daten analysieren möchten.
- als Kliniker*in Sequenzierungsdaten in einem klinischen oder translationalen Kontext interpretieren möchten.
- in der Biotechnologie, der Pharmaindustrie oder einer verwandten Branche tätig sind, in der Sequenzierungsanalysen zunehmend an Bedeutung gewinnen.
Sie sollten über ein grundlegendes Verständnis der Molekularbiologie verfügen, erste praktische Erfahrung mit einer Programmiersprache wie Python haben und eine starke Motivation mitbringen, Ihre rechnergestützten Fähigkeiten weiterzuentwickeln.
Aufbau und Inhalte
Dieses berufsbegleitende, modular aufgebaute Programm umfasst drei fokussierte Module, in denen Sie fundiertes Fachwissen und praktische Fähigkeiten erwerben, die Sie direkt in Ihrer beruflichen Praxis anwenden können.
Mit einer Einführung in grundlegende Programmierkonzepte, Datenmanagement und wichtige bioinformatische Berechnungswerkzeuge beginnend, werden Sie anschliessend ein vertiefendes Training zur Analyse von Rohsequenzierungsdaten aus Next-Generation Sequencing (NGS) und Oxford Nanopore Technologies (ONT) erhalten. Dabei werden die Dateiformate, Qualitätskontrolle, Alignment, Variant Calling und metagenomische Pipelines abdeckt. Das letzte Modul konzentriert sich auf die Interpretation von Sequenzierungsergebnissen im biologischen und klinischen Kontext, einschliesslich Genexpressionsprofilierung, Variantenannotation und Integration mit öffentlichen Datensätzen.
Module 1: Computer- und Softwareentwicklung
Module 2: Vorverarbeitung und Analyse bioinformatischer Daten
Module 3: Interpretation bioinformatischer Daten
Voraussetzungen und Zulassung
Für die Zulassung zum Programm gelten folgende Voraussetzungen:
- Tertiär A: Hochschulabschluss (mind. Bachelorabschluss) und mindestens 2 Jahre für die Weiterbildung relevante Praxiserfahrung,
- Tertiär B: Diplom Höhere Fachschule HF, eidg. Höhere Fachprüfung HFP oder eidg. Berufsprüfung BP und mindestens 5 Jahre für die Weiterbildung relevante Praxiserfahrung,
- Personen ohne Tertiär A- oder B-Abschluss können aufgenommen werden, wenn sie folgende Zulassungskriterien kumulativ erfüllen:
- mindestens 10 Jahre Berufserfahrung in einem für die Weiterbildung relevanten Berufsfeld; davon mind. 5 Jahre in einer Führungs- oder höheren Fachfunktion,
- ausgewiesene sonstige Qualifizierung (verschiedene nicht-formale, umfangreiche Weiterbildungen oder Teilleistung (>50%) tertiärer Bildungsgrad),
- Nachweis erworbene Kenntnisse zu wissenschaftlichem Arbeiten oder Bereitschaft diese vorgängig zu erwerben.
Da die Unterrichts- und Schulungsunterlagen auf Englisch sind, werden Englischkenntnisse auf mindestens Niveau C1 vorausgesetzt.
Für das Programm ist ein eigener Laptop bzw. ein persönliches Notebook erforderlich.
Organisatorisches
Format
Downloads
Beratung und Info-Anlässe
Kontakt
Prof. Dr. Abdullah Kahraman
- Telefon
- +41 61 228 62 23
Info-Anlässe
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Anmeldung
CAS Applied Bioinformatics: Next- and 3rd Generation Sequencing Data Analysis1. April 2027
- Datum
- 1.4.2027
- Dauer
- 12 Tage
- Ort
- Online (erste und letzte Vorlesung vor Ort)
- Kursleitung
- Prof. Dr. Abdullah Kahraman
- Anmeldeschluss
- 11.2.2027